More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0908 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  96.84 
 
 
474 aa  863    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
485 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  82.17 
 
 
485 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.1 
 
 
484 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.84 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.08 
 
 
484 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.92 
 
 
495 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  47.43 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.11 
 
 
479 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  48.85 
 
 
496 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.63 
 
 
480 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  47.6 
 
 
477 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.78 
 
 
485 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.63 
 
 
476 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.57 
 
 
485 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.35 
 
 
493 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.94 
 
 
485 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.84 
 
 
493 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.93 
 
 
476 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.32 
 
 
490 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.7 
 
 
491 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.36 
 
 
220 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.16 
 
 
213 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.37 
 
 
225 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.43 
 
 
213 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.94 
 
 
213 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.47 
 
 
260 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.33 
 
 
206 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.53 
 
 
209 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.68 
 
 
211 aa  206  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.55 
 
 
217 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.64 
 
 
224 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.61 
 
 
224 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.19 
 
 
207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.39 
 
 
237 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  50.52 
 
 
235 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.56 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  49.47 
 
 
218 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.5 
 
 
217 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.27 
 
 
219 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  49.47 
 
 
218 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  33.4 
 
 
507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.48 
 
 
202 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  49.47 
 
 
218 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.01 
 
 
546 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.7 
 
 
214 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
217 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
217 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.61 
 
 
224 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.87 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.85 
 
 
244 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.29 
 
 
223 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.29 
 
 
223 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.03 
 
 
229 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.42 
 
 
247 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.52 
 
 
230 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.52 
 
 
230 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.7 
 
 
207 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  38.49 
 
 
299 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.64 
 
 
300 aa  166  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  48.97 
 
 
211 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.71 
 
 
223 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.56 
 
 
229 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  34.62 
 
 
265 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.53 
 
 
217 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.15 
 
 
279 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  33.72 
 
 
264 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.17 
 
 
208 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.21 
 
 
216 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  38.02 
 
 
279 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.31 
 
 
216 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
206 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  36.9 
 
 
295 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.09 
 
 
210 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  37.3 
 
 
279 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.8 
 
 
222 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  36.29 
 
 
282 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.75 
 
 
264 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  35.71 
 
 
279 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.43 
 
 
205 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.08 
 
 
315 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.16 
 
 
317 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.78 
 
 
276 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.07 
 
 
245 aa  123  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  34.3 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.24 
 
 
243 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  34.89 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.62 
 
 
323 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.74 
 
 
205 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.04 
 
 
334 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
201 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  35 
 
 
278 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.43 
 
 
285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  43.3 
 
 
213 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.02 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.46 
 
 
309 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.78 
 
 
271 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.76 
 
 
207 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.9 
 
 
264 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>