165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0231 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  84.94 
 
 
353 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  97.59 
 
 
351 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  61.97 
 
 
357 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  65.1 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  58.99 
 
 
355 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  57.51 
 
 
371 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  52.53 
 
 
356 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  53.59 
 
 
368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  50 
 
 
358 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  48.18 
 
 
366 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  47.73 
 
 
367 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  46.22 
 
 
366 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  47.14 
 
 
366 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  47 
 
 
386 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  47.31 
 
 
377 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  46.44 
 
 
363 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  46.5 
 
 
379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  47.14 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  45.51 
 
 
365 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  45.33 
 
 
376 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  45.45 
 
 
390 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  45.93 
 
 
375 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  45.22 
 
 
365 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  45.28 
 
 
375 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  50.29 
 
 
356 aa  258  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  50.84 
 
 
367 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  51.96 
 
 
356 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  44.2 
 
 
375 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  48.6 
 
 
351 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  45.87 
 
 
376 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  52.71 
 
 
362 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  53.33 
 
 
361 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  35.69 
 
 
349 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  53.14 
 
 
367 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  52.87 
 
 
361 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  48.2 
 
 
364 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  37.75 
 
 
366 aa  235  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  49.7 
 
 
339 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.98 
 
 
351 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  34.15 
 
 
335 aa  229  7e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  34.76 
 
 
335 aa  227  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  36.47 
 
 
323 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  40.4 
 
 
402 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.99 
 
 
515 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.89 
 
 
324 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.42 
 
 
449 aa  203  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.14 
 
 
461 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  31.74 
 
 
504 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.36 
 
 
370 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.02 
 
 
393 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  32.6 
 
 
417 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  32.32 
 
 
388 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.79 
 
 
387 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.69 
 
 
384 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  34.18 
 
 
386 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.48 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.48 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  35.21 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.46 
 
 
394 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.27 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  34.11 
 
 
393 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  34.28 
 
 
386 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.94 
 
 
349 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.85 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 
398 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.96 
 
 
395 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.47 
 
 
385 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  26.63 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.86 
 
 
410 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  34.72 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  28.81 
 
 
386 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  35.77 
 
 
404 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.32 
 
 
393 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  26.86 
 
 
397 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.38 
 
 
396 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  28.57 
 
 
385 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.65 
 
 
370 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.65 
 
 
370 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  27.83 
 
 
377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.89 
 
 
378 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.27 
 
 
360 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  32.75 
 
 
384 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  33.99 
 
 
368 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  33.04 
 
 
358 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.69 
 
 
396 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  34.15 
 
 
397 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  27.9 
 
 
395 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.09 
 
 
396 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  27.04 
 
 
377 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  32.09 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  33.6 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  28.87 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  30.64 
 
 
410 aa  96.3  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  32.6 
 
 
410 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  32.6 
 
 
410 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  29.11 
 
 
394 aa  96.3  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.69 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.69 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>