170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1730 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  97.22 
 
 		 97 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  58.9 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  57.53 
 
 		 102 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.76 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.76 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  56.16 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.57 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.05 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  46.15 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.59 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  48.61 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.22 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.71 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.3 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  43.04 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  45.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.21 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  40.26 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.24 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.21 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  36.84 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.89 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.1 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  43.48 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  40 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  43.59 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  43.59 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.19 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  43.59 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  43.59 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  43.59 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.9 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  37.14 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  44.59 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  43.24 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  36.36 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.91 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  40.35 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.89 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.89 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.89 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.55 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.38 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  44.26 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.03 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.55 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.28 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.38 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  37.1 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  31.08 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  34.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.28 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  37.31 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.77 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.77 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  35.21 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.37 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  50 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.418842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.8 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  40.85 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.28 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.94 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.94 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.1 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.1 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>