More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2198 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  71.25 
 
 		 484 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  90.36 
 
 		 495 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 531 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  70.44 
 
 		 486 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 512 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  69.18 
 
 		 486 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 523 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  69.58 
 
 		 487 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 545 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  75.2 
 
 		 488 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  71.25 
 
 		 484 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  70.95 
 
 		 484 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 529 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 585 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  70.23 
 
 		 488 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  71.46 
 
 		 485 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  75.26 
 
 		 511 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  100 
 
 		 481 aa  960    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  92.31 
 
 		 498 aa  869    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  72.54 
 
 		 484 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  73.29 
 
 		 520 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  74.2 
 
 		 483 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  73.08 
 
 		 535 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  66.04 
 
 		 483 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  74.07 
 
 		 504 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  76.81 
 
 		 505 aa  715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  75.26 
 
 		 511 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  76.54 
 
 		 501 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  72.15 
 
 		 490 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  73.03 
 
 		 486 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  75.88 
 
 		 500 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  71.31 
 
 		 490 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  75.26 
 
 		 511 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  72.05 
 
 		 484 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  76.08 
 
 		 500 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  74.08 
 
 		 504 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  67.01 
 
 		 495 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  62.63 
 
 		 485 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  69.34 
 
 		 511 aa  617  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  66.32 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  63.1 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  60.17 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  60.66 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  69.2 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  60.04 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  60.54 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  65.62 
 
 		 510 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  60.87 
 
 		 534 aa  588  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  59.16 
 
 		 536 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  61.55 
 
 		 485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  60.08 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  59.41 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  59.41 
 
 		 565 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  59.21 
 
 		 526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  61.55 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  59.68 
 
 		 541 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  58.81 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  59.68 
 
 		 541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  59.27 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  59.08 
 
 		 541 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  56.41 
 
 		 527 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  59 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  58.8 
 
 		 523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  56.43 
 
 		 536 aa  542  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  59.55 
 
 		 502 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  54.36 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  53.99 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  53.14 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  54.2 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  52.72 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  52.51 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  52.92 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  52.1 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  53.56 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  52 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  51.05 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  52.94 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  53.67 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  50.85 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  52.84 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  50 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  53.03 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  53.03 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  52.82 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  52.74 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  52.32 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  54.55 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.89 
 
 		 787 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  52.84 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  54.3 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  47.59 
 
 		 480 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  48.77 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  48.25 
 
 		 524 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  50.64 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.88 
 
 		 776 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  50.1 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  53.08 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  51.46 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  53.6 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>