More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3369 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  79.06 
 
 
431 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
417 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  44.22 
 
 
382 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  38.97 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  39.49 
 
 
366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 
386 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
385 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
395 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
374 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
370 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
370 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
371 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
397 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  39.85 
 
 
381 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 
381 aa  199  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  42.38 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
398 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
393 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
370 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  41.96 
 
 
380 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
435 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
380 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
434 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  40.07 
 
 
346 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  40.07 
 
 
346 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  38.8 
 
 
380 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
374 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 
398 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
381 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  38.94 
 
 
375 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
376 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
376 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
420 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
360 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 
380 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
387 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
387 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
390 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
371 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
378 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  32.74 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  36.95 
 
 
375 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
369 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
381 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  32.3 
 
 
375 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  41.64 
 
 
376 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  36.33 
 
 
428 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  35.59 
 
 
430 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  41.01 
 
 
376 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
394 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  35.93 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  39.55 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
535 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  37.21 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
361 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  38.72 
 
 
361 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.72 
 
 
401 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.82 
 
 
351 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 
382 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 
371 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
367 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
383 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
394 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
378 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
374 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.59 
 
 
364 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
372 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
372 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  35.54 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
382 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 
524 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 
394 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
361 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.93 
 
 
361 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
423 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  34.83 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.08 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
1261 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
368 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.13 
 
 
372 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
380 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
376 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>