More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0829 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  74.8 
 
 
498 aa  751    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  61.17 
 
 
500 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  97.18 
 
 
497 aa  999    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
503 aa  1033    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  67.54 
 
 
498 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  65.72 
 
 
505 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  61.55 
 
 
493 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  61.24 
 
 
516 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  56.59 
 
 
499 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
498 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  60.99 
 
 
493 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  57.32 
 
 
493 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  57.17 
 
 
496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  53.67 
 
 
496 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  53.78 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  46.58 
 
 
483 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  46.99 
 
 
483 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.68 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
529 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.586199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  45.61 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
480 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
481 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  43.31 
 
 
480 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 
477 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 
491 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
480 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  43.19 
 
 
477 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
482 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
476 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
481 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
485 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
479 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 
510 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
485 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
480 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.33 
 
 
502 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 
478 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
477 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
493 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.77 
 
 
478 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 
482 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
493 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.45 
 
 
488 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
478 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
482 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
477 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2080  Aldehyde Dehydrogenase  40.76 
 
 
530 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
475 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
498 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 
496 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  40.79 
 
 
493 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
493 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  40.25 
 
 
488 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
488 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  40.46 
 
 
493 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 
493 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 
482 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
493 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
490 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
482 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
479 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
490 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  41.39 
 
 
477 aa  359  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  41.39 
 
 
477 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.83 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  42.53 
 
 
485 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
480 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.46 
 
 
498 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  39.26 
 
 
501 aa  352  7e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
479 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
496 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
489 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
479 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.93 
 
 
494 aa  347  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
483 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
482 aa  346  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
493 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
501 aa  345  8.999999999999999e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
478 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2249  Aldehyde Dehydrogenase  39.88 
 
 
529 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408136  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
446 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.66 
 
 
508 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6477  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.24 
 
 
511 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140482  normal  0.0817062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.49 
 
 
505 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
506 aa  343  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
474 aa  343  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 
482 aa  343  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
494 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.16 
 
 
476 aa  342  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
490 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
483 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
489 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  38.99 
 
 
510 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
490 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>