115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0280 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  100 
 
 		 329 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  60.12 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  51.85 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  51.23 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  49.85 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  49.85 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  47.42 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  49.69 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  48.16 
 
 		 333 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  46.75 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  42.81 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  40.79 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  40.85 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38.63 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  48.02 
 
 		 197 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  42.53 
 
 		 192 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  53.66 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  55.2 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  43.33 
 
 		 210 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  43.08 
 
 		 198 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  56 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  50.4 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  49.59 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  48.76 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  51.59 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  47.11 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  49.57 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  47.11 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  50.43 
 
 		 120 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  46.28 
 
 		 281 aa  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  43.75 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  43.08 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  50 
 
 		 135 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.48 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  46.09 
 
 		 358 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 141 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  50.86 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  45.3 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  47.97 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  43.65 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  42.5 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  40.48 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  43.09 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  43.44 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  43.44 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  44.53 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.65 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  41.73 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  39.23 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  42.75 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  44 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  42.28 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  41.94 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  38.76 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  40.32 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  40.43 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  39.37 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  39.32 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  42.97 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  41.9 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  43.09 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  38.93 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  39.09 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  38.89 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  38.89 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  45.13 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  40.95 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  38.76 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  36.29 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  35.48 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  35.48 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  40.17 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  39.32 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  42.5 
 
 		 144 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  47.42 
 
 		 121 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  37.9 
 
 		 342 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  36.97 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  34.92 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  35.94 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  33.91 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  37.9 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  52.17 
 
 		 93 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  42.17 
 
 		 90 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  50 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  59.26 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  44.93 
 
 		 73 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  44.59 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  48.08 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  46.88 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  34.55 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 98 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  30.26 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  36.49 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>