More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5378 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3243  ABC transporter related  53.46 
 
 		 229 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  47.1 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  48.65 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  50.19 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.54 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  45.37 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  44.08 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.4 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.14 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.74 
 
 		 418 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.4 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.08 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.25 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  41.15 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.35 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  38.89 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.6 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  43.15 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  38.46 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.56 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.73 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  40.83 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.31 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.86 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.61 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  39.59 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  40.49 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.27 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  45.81 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  39.36 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  39.36 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  40.61 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.59 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.93 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.85 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.26 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 		 418 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>