More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5252 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  100 
 
 		 398 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  64.32 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  59.51 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  57.71 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  55.5 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  52.99 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  52.99 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  52.34 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  50.51 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  46.48 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  45.76 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  46.37 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  70.35 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  70.35 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  43.17 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  74.43 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  58.87 
 
 		 493 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  68.91 
 
 		 585 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  54.98 
 
 		 506 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  54.98 
 
 		 506 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  71.51 
 
 		 568 aa  255  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  69.95 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  69.07 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  59.34 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  41.99 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  58.3 
 
 		 502 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.14 
 
 		 404 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  44.61 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  70.79 
 
 		 572 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  65 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.82 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  70.79 
 
 		 349 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  40.24 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  39.76 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  67.43 
 
 		 567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  41.79 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  41.79 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  74.52 
 
 		 160 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  41.42 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  37.38 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  39.42 
 
 		 388 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  40.34 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  40.34 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  38.66 
 
 		 420 aa  216  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  37.04 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  38.81 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  36.79 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  39.21 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  37.78 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  37.81 
 
 		 377 aa  209  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  38.79 
 
 		 319 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  37.78 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.95 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  38.56 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  37.94 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  35.73 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  37.84 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  38.44 
 
 		 319 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  35.58 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  36.59 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  36.12 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  36.61 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  37.72 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  34.91 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  37.41 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  35.92 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  52.94 
 
 		 609 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  35.91 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  55.56 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  33.41 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  63.06 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  62.42 
 
 		 492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  54.87 
 
 		 493 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 		 497 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  60 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  65.1 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  33.74 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  32.92 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  56.98 
 
 		 494 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  61.78 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  62.99 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  56.47 
 
 		 475 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  56.4 
 
 		 506 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  34.89 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  55.17 
 
 		 492 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  55.17 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  33.96 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  55.88 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  59.75 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  58.24 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  55.17 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>