58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3208 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  83.54 
 
 		 393 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 397 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  58.33 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  52.55 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  61.08 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  51.61 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  52.42 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  50.4 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  51.77 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.69 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  51.6 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 		 389 aa  358  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  51.59 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  54.2 
 
 		 379 aa  358  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  51.32 
 
 		 365 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  51.76 
 
 		 366 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  51.22 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  50.53 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  50.53 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  50.53 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  50.53 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  49.73 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  51.43 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  49.19 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  46.95 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  50.13 
 
 		 385 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  45.48 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  43.05 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  43.05 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.89 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.42 
 
 		 360 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  39.67 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.87 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.5 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.53 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  29.72 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.89 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  32.79 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  28.74 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  30.36 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.82 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  23.53 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  20.92 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  20.1 
 
 		 934 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.76 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  21.13 
 
 		 444 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  26.02 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  25.6 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>