251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1262 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  100 
 
 		 325 aa  641    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  39.03 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  37.46 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  39.02 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  36.51 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  32.9 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  36.14 
 
 		 301 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  35.79 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  35.79 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  35.65 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  36.36 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  36.59 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  32.33 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  33.55 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  35.96 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  33.68 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  33.68 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  35.92 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  35.71 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  36.14 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  35.42 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  38.56 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  38.56 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  32.97 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  34.08 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  34.53 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  33.44 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33.76 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  33.12 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  33.76 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.2 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  33.45 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  32.8 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  32.8 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  32.8 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.99 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  32.05 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.26 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  34.11 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  32.91 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  40.46 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  31.73 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  38 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34.29 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  29.64 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  35.23 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  31.86 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  33.77 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  31.52 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  34.34 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  32.8 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  36.05 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  31.94 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  35.4 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  36.45 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  32.8 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  31.55 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  33.02 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  33.02 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  41.67 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.78 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  37.12 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  32.54 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  29.43 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.71 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  38.23 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.67 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  30.77 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  31.93 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  32.64 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  32.37 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  33.67 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  32.37 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  28.68 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  32.37 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  32.37 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  32.37 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.65 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  38.51 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  31.19 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  31.21 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  33.8 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  30.26 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  29.84 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  38.53 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  34.11 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  31.61 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.45 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  31.45 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  32.85 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  37.22 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  32.62 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>