More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4546 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  93.73 
 
 
335 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
335 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  76.59 
 
 
334 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  52.41 
 
 
330 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  51.96 
 
 
332 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  52.7 
 
 
346 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  51.45 
 
 
313 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  50.65 
 
 
327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  52.98 
 
 
317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  49.83 
 
 
332 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  47.42 
 
 
322 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  47.7 
 
 
346 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  48.15 
 
 
325 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  49 
 
 
314 aa  272  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 
307 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  51.68 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  51.68 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  51.35 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  46.86 
 
 
324 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  47.85 
 
 
321 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
330 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  46.95 
 
 
318 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.44 
 
 
310 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
312 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 
318 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  44.69 
 
 
314 aa  222  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  40.59 
 
 
317 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
303 aa  175  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
310 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
307 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
336 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
308 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
319 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
308 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.86 
 
 
305 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
374 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
394 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
229 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
227 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.02 
 
 
410 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
394 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.49 
 
 
410 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
272 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.71 
 
 
410 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
282 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
238 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
221 aa  92.8  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
227 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
311 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
230 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.75 
 
 
382 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
531 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
227 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
527 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
519 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
527 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
378 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
448 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  26.62 
 
 
299 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
287 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
226 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
388 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  31.02 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>