127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2494 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  43.58 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.18 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  42.28 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  41.85 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  41.19 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  41.32 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  41.23 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  42.35 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  41.55 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  40.14 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  39.94 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  35.78 
 
 		 341 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  41.33 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  40.4 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  39.75 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  40.4 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  41 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  41.41 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  40.07 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  40.4 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  40.4 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  36.7 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.94 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  40.07 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  40.88 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.62 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.44 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.62 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  35.91 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  39.12 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  37.42 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  40.2 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.75 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  38.56 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  38.44 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  37.7 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  35.2 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.4 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  38.87 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  37.67 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  36.33 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  36.49 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  36.49 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.05 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  36.15 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  36.79 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  37.23 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  36.79 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  35.02 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  35.35 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  34.68 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  33.96 
 
 		 319 aa  179  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  40.76 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  31.77 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  30.98 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  32.18 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  31.02 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  33.66 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  28.75 
 
 		 584 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  30.85 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.39 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  33 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  30.64 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  31.63 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  28.19 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.18 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  31.58 
 
 		 640 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  27.42 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  28.87 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  30.95 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  28.23 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 347 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.69 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.03 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27.24 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  26.22 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  29.34 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  26.95 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25.78 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  27.55 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  29.17 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.54 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  27.52 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.04 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25.7 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.84 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>