More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0672 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 404 aa  840    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  34.92 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.92 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  35.09 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 417 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.25 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  29.44 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.81 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 434 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.14 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 411 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 409 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  26.28 
 
 		 399 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.12 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 414 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  24.43 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  24.75 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.62 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  24.26 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 1340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.18 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 499 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 		 703 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 994 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 902 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 535 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 956 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  23.21 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  24.94 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 1106 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  26.4 
 
 		 1119 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  20.89 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 824 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  22.38 
 
 		 1156 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  27.86 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>