51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0067 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  56.48 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  53.26 
 
 		 127 aa  103  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  46.73 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  47.66 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  52.17 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  49.53 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  45.36 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  46.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  49.53 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  42.48 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  45.36 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  46.67 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  47.78 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  46.46 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  48.15 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  46.43 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  46.91 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  41.11 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  41.67 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  43.01 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  25.44 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  24.56 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.81 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  35.48 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  31.58 
 
 		 140 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0760  ribosomal protein L12E/L44/L45/RPP1/RPP2-like protein  30.51 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  27.12 
 
 		 131 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  27.12 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  27.12 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30.65 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  31.58 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  31.15 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>