More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2164 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  61.89 
 
 
774 aa  845    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
652 aa  1345    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  72.67 
 
 
687 aa  957    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  91.27 
 
 
653 aa  1244    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
963 aa  229  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  37.02 
 
 
431 aa  227  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  45.91 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  45.53 
 
 
490 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  44.33 
 
 
457 aa  221  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
457 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 
505 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  44.64 
 
 
437 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  36.05 
 
 
415 aa  210  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  36.96 
 
 
475 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
486 aa  203  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  43.01 
 
 
500 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
611 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
777 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  36.7 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
771 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  41.64 
 
 
774 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  36.14 
 
 
423 aa  183  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
499 aa  183  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  36.42 
 
 
432 aa  180  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
619 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  40.15 
 
 
461 aa  178  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.77 
 
 
1682 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  40 
 
 
475 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  40 
 
 
762 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 
861 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  30.7 
 
 
352 aa  170  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
642 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
587 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
484 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  30.61 
 
 
445 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
621 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  40 
 
 
485 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
752 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  37.89 
 
 
407 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
643 aa  160  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  37.45 
 
 
427 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
795 aa  158  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
615 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
526 aa  157  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
612 aa  157  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.5 
 
 
707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  36.07 
 
 
604 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
651 aa  153  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
357 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
414 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  31.97 
 
 
324 aa  152  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.32 
 
 
700 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.49 
 
 
622 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
415 aa  150  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2051  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
429 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0809691  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
646 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.52 
 
 
647 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  33.08 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.93 
 
 
584 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
602 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.39 
 
 
322 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.49 
 
 
602 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  42.38 
 
 
403 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
502 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  30.22 
 
 
322 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.17 
 
 
1454 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.14 
 
 
638 aa  144  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 
322 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  35.12 
 
 
668 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.83 
 
 
2122 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
590 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 
457 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 
691 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.97 
 
 
676 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.95 
 
 
603 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.04 
 
 
579 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.9 
 
 
593 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
599 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  34.67 
 
 
609 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.9 
 
 
863 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1668  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
431 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 
487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.88 
 
 
681 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36 
 
 
613 aa  137  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  33.73 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
746 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2348  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
432 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.38 
 
 
591 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  34.77 
 
 
625 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  31.84 
 
 
625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.41 
 
 
635 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.62 
 
 
641 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 
450 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
518 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.47 
 
 
666 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
285 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>