283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4028 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  100 
 
 		 354 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  68.29 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.29 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.5 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  33.18 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.13 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  35.23 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  32.05 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  32.05 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  34.88 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  32.95 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  30.14 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  30.97 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.96 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  30.74 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  33.33 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.49 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  29.1 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.73 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  29.81 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  26.76 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  31.3 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  25.86 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  33.33 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  28.29 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  32.42 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  29.66 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  29.18 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  30.03 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.95 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.63 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  28.34 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  29.09 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  27.24 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  26.53 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.58 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  29.44 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.37 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  27.62 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  28.43 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  30.39 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  31.15 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  38.83 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  27.43 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  34.72 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  27.75 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  29.32 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  31.9 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  36.76 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  27.99 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.27 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  26.44 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  33.95 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.22 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  30.43 
 
 		 660 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  31.64 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.48 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  30.39 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.82 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  26.14 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.03 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  32.32 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.58 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  25.39 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.28 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  28.84 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  29.63 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  26.57 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  29.2 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2203  acyltransferase 3  35.5 
 
 		 432 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000295362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  31.76 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 695 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  27.94 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  27.38 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>