More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0913 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0913  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
206 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.51 
 
 
206 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.27 
 
 
206 aa  324  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.39 
 
 
206 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.419854  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.74 
 
 
204 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.1 
 
 
248 aa  226  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0406  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.33 
 
 
203 aa  223  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00846941  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.78 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.01 
 
 
258 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
257 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
258 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
257 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
257 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
243 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
258 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 
263 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
263 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.31 
 
 
258 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
260 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
259 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
254 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.51 
 
 
262 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.79 
 
 
257 aa  101  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
273 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
263 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
263 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
252 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
254 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 
263 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 
262 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
257 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.05 
 
 
260 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
263 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.95 
 
 
278 aa  99  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.54 
 
 
269 aa  97.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
261 aa  97.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
259 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35.91 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.91 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
268 aa  97.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  37.29 
 
 
256 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
257 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.54 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 
260 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 
288 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
269 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
260 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.88 
 
 
692 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.37 
 
 
262 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.02 
 
 
661 aa  95.5  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 
260 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
260 aa  95.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
260 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
260 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
261 aa  94.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
244 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
262 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.48 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
267 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.08 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 
253 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
262 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
267 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
260 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 
262 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.31 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 
259 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 
260 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
280 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.28 
 
 
662 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
265 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
267 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
255 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>