More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0096 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  100 
 
 		 292 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  80 
 
 		 289 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  71.88 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  69.79 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  65.07 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  62.41 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  62.5 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  52.79 
 
 		 325 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  52.92 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  52.8 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.7 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  51.66 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.11 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  47.19 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.93 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  45.56 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.86 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  44.61 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  49.1 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  38.87 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.49 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.75 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.23 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  49.81 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.31 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  41.49 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  46.27 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  44 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.98 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  46.07 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  46.1 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  46.47 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.96 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  47.17 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  39.71 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.69 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.64 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  44.28 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  40.94 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  43.62 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  43.78 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  36.18 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.84 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.31 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  40.83 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.67 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  39.68 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.95 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  39.13 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  45.74 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  48.07 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  42.38 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  39.46 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  38.01 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.21 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  40.59 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  45.11 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.07 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  37.81 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  42.81 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.19 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.45 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  38.95 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  43.02 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  37.94 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.8 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.46 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  42.45 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.97 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  37.94 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  39.75 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.42 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  40.56 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.11 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.15 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.35 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.32 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  36.03 
 
 		 587 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 587 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.75 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  38.52 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  43.85 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.89 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.42 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  43.55 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.35 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.97 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  43.85 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  43.15 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  43.4 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.29 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.67 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.96 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  40.52 
 
 		 274 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  42.86 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  46.72 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>