55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2425 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  78.15 
 
 		 176 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  73.38 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  66.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  65.33 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  47.88 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  42.86 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  45.88 
 
 		 321 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  48.3 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  43.67 
 
 		 243 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  41.98 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  39.77 
 
 		 323 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  40.65 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  36.2 
 
 		 357 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  38.96 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.2 
 
 		 365 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  41.72 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  41.55 
 
 		 319 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.88 
 
 		 318 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  39.74 
 
 		 338 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  37.93 
 
 		 334 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  41.06 
 
 		 320 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  37.93 
 
 		 351 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  34.86 
 
 		 357 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.01 
 
 		 327 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  44.3 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.71 
 
 		 342 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  35.14 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5009  nuclear export factor GLE1  37.58 
 
 		 146 aa  91.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  34.93 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  34.24 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  33.55 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  36.48 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  34.48 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  35.75 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  33.91 
 
 		 247 aa  77.4  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  36.7 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  32.24 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  31.41 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  29.81 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  32.69 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  28.76 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  29.95 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  30.82 
 
 		 251 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.88 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  28.67 
 
 		 206 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>