75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2405 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 321 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  68.85 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  70.53 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  68.12 
 
 		 319 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  70.09 
 
 		 321 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  68.97 
 
 		 323 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  69.91 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  33.15 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.26 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  26.09 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  37.31 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  31.87 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  29.28 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  31.29 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.81 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  32 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  32.03 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  25.52 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.89 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  31.37 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  27.11 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  29.88 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  30.73 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  24.47 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.42 
 
 		 625 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  26.8 
 
 		 245 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  32.84 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  26.44 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  33.81 
 
 		 657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  25.61 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.69 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  28.86 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  34.87 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  33.58 
 
 		 657 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  33.58 
 
 		 657 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  33.58 
 
 		 657 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.9 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  28.31 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  30.92 
 
 		 707 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  32.5 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  29.26 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  31.93 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30.72 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  24.58 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  30.19 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  29.48 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  24.23 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  26.97 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  26.4 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  26.09 
 
 		 252 aa  46.2  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  30.34 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  31.54 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  27.43 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  24.26 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  32.61 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  31.33 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.1 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  26.82 
 
 		 1364 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  28.97 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28.03 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.23 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  32.06 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  24.07 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  25.32 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  28.5 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  24.83 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  27.33 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  25.16 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 		 228 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  29.65 
 
 		 278 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  30.6 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  27.91 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>