More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3398 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  85.35 
 
 
662 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
662 aa  1345    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  50.36 
 
 
529 aa  293  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  52.08 
 
 
526 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  55.82 
 
 
738 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  49.82 
 
 
524 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  50.18 
 
 
526 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  51.15 
 
 
532 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  54.88 
 
 
516 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  48.18 
 
 
561 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  44.32 
 
 
465 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  49.66 
 
 
446 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  48.97 
 
 
463 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  52.5 
 
 
462 aa  257  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  47.71 
 
 
479 aa  256  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  47.85 
 
 
460 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  37.05 
 
 
472 aa  195  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
665 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.1 
 
 
636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.56 
 
 
518 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  40.8 
 
 
694 aa  138  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 
758 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
744 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  39.88 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
746 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  35.45 
 
 
729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
864 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.43 
 
 
611 aa  132  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
861 aa  131  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.28 
 
 
701 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.62 
 
 
936 aa  130  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.2 
 
 
431 aa  130  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 
860 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.43 
 
 
638 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  29.88 
 
 
441 aa  127  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1172 aa  127  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.81 
 
 
757 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 
752 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.07 
 
 
577 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
1207 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
667 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 
859 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.63 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.74 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.68 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.05 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.5 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.46 
 
 
761 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
1156 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  33.18 
 
 
546 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  27.55 
 
 
487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.06 
 
 
528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.15 
 
 
656 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.12 
 
 
584 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
822 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.36 
 
 
903 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.31 
 
 
656 aa  120  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.87 
 
 
737 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.31 
 
 
672 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 
536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  31.85 
 
 
483 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  31.45 
 
 
483 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 
702 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.04 
 
 
658 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.78 
 
 
879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  31.78 
 
 
684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
1180 aa  117  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
1093 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 
741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.06 
 
 
604 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
911 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
713 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.22 
 
 
1020 aa  114  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.2 
 
 
815 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.88 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.62 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.8 
 
 
858 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  31.28 
 
 
701 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
593 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  32.51 
 
 
744 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  30.41 
 
 
717 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.65 
 
 
632 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  30.81 
 
 
701 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.08 
 
 
754 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.46 
 
 
696 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.69 
 
 
678 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.28 
 
 
588 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
403 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
712 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
641 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
794 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
645 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  36.22 
 
 
724 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>