More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0095 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  651  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  95.68 
 
 
324 aa  607  1e-172  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  94.14 
 
 
324 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  91.98 
 
 
324 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  87.96 
 
 
324 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.32 
 
 
324 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  55.86 
 
 
324 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.35 
 
 
326 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.66 
 
 
326 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
326 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
334 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 
323 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  52.8 
 
 
326 aa  345  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 
326 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 
325 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  49.38 
 
 
325 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
325 aa  332  7e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  51.54 
 
 
324 aa  331  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.38 
 
 
328 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  49.23 
 
 
325 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  49.23 
 
 
325 aa  327  1e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.85 
 
 
324 aa  328  1e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
325 aa  327  1e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.85 
 
 
324 aa  327  2e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
361 aa  326  4e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.31 
 
 
324 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
324 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 
324 aa  322  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.62 
 
 
324 aa  320  2e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  51.23 
 
 
324 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
325 aa  319  4e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.76 
 
 
325 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
325 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
325 aa  312  5e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
324 aa  307  1e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 
324 aa  306  4e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
326 aa  305  5e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
326 aa  305  9e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
326 aa  305  9e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 
331 aa  302  4e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
333 aa  302  6e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.15 
 
 
324 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
324 aa  299  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
326 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
326 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
324 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  48.77 
 
 
326 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 
332 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.38 
 
 
326 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 
324 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  47.45 
 
 
337 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
324 aa  273  2e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 
324 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.24 
 
 
328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
326 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
324 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  46.89 
 
 
325 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
340 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
326 aa  254  1e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
327 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
319 aa  244  2e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
324 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
319 aa  234  2e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 
324 aa  234  2e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
324 aa  234  2e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.67 
 
 
325 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  46.13 
 
 
319 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
319 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  42.68 
 
 
325 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
335 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 
324 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 
323 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.23 
 
 
327 aa  221  2e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
327 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 
326 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
322 aa  215  6e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.58 
 
 
327 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
324 aa  214  1e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
325 aa  214  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 
332 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.58 
 
 
326 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.39 
 
 
322 aa  208  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
331 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  40.18 
 
 
336 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
325 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
322 aa  199  4e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1046  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.15 
 
 
322 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0321902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
324 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.14 
 
 
333 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.91 
 
 
323 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 
329 aa  198  1e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
324 aa  197  2e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
331 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
335 aa  196  4e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  37.8 
 
 
323 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>