More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1171 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  96.12 
 
 
258 aa  502  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
253 aa  318  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
261 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 
260 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
260 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.67 
 
 
275 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  48.84 
 
 
257 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  47.67 
 
 
257 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.29 
 
 
257 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.99 
 
 
255 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
265 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  45.88 
 
 
283 aa  228  5e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
257 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  47.43 
 
 
257 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 
258 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 
257 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.47 
 
 
258 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 
258 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
256 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  47.35 
 
 
269 aa  224  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.75 
 
 
255 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 
254 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
258 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.64 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
255 aa  221  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.14 
 
 
255 aa  222  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.75 
 
 
255 aa  221  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
258 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  47.41 
 
 
258 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  49.38 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.64 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  47.37 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  47.37 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  47.76 
 
 
258 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
258 aa  218  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.46 
 
 
258 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
256 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
258 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 
262 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
266 aa  216  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.54 
 
 
265 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.58 
 
 
257 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.28 
 
 
257 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
258 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.7 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
258 aa  214  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  47.52 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.15 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
259 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
257 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
258 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.14 
 
 
255 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  44.58 
 
 
257 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
257 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
258 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
259 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  47.76 
 
 
258 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
257 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
254 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 
259 aa  208  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  47.76 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  47.76 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
257 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
258 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>