76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2103 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  51.52 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0174  hypothetical protein  47.06 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862833 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  29.34 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  29.34 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  32.95 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  32.95 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  32.95 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  33.59 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  32.39 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  32.81 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  30.69 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  31.4 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  30.81 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  34.15 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  30.73 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  34.35 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  32.53 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  25.32 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  32.37 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  24.37 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  26.63 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  30.88 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  25.47 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  25.47 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  31.45 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  31.97 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  25.47 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  27.01 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  26.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  24.75 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  23.44 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  29.66 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  27.95 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  24.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  22.73 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  23.27 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  24.03 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  25.34 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  23.27 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  23.27 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  23.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  26.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  32.94 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  25.95 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  23.27 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  23.76 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  26.62 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  26.62 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  31.08 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  24.16 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  32.94 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  23.12 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  22.77 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  22.77 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  28 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  22.77 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  26.34 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  20.61 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  28.18 
 
 		 210 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>