45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0174 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  88.21 
 
 		 212 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  47.06 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  31.32 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  30.77 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  30.77 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  30.77 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  27.27 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  29.59 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  29.76 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  27.91 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  27.91 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  29.51 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  31.62 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  31.48 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  31.25 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  24.86 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  25.77 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  26.95 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  24.73 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  31.48 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  30.94 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  22.98 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  27.6 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  27.6 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  24.38 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  26.09 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  25.97 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  28.79 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  38.89 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  38.89 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  25.56 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  25.12 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  27.03 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  28.3 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  25.84 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  27.85 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  23.3 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  26.85 
 
 		 203 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  25.32 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  23.7 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  23 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>