95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0343 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  38.34 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  36.41 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  36.31 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  30.21 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  30.21 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  32.93 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  31.58 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  33.93 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  33.93 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  30.49 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  29.95 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  34.18 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  30.53 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  28.21 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  28.21 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  28.79 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  29.41 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  27.69 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  27.69 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  20.51 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  23.62 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  26.99 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  25.39 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  24.35 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  25.23 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  25.23 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  26.67 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  24.19 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  28.5 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  23.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  23.74 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  25.67 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  25.26 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  27.71 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3555  putative outer membrane lipoprotein LolB  16.23 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  26.11 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  28.82 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  23.56 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  21.99 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  21.99 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  22.8 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  23.35 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  25.13 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  23.16 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  25.79 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  25.98 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  21.32 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  22.05 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  22.84 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  23.98 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  23.16 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  23.98 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  25.26 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3461  outer membrane lipoprotein LolB  27.1 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0667609  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  22.63 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  22.63 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  22.11 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  27.07 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  21.39 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0721  outer membrane lipoprotein LolB  23.47 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0885014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  28.5 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  26.52 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  30.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  24.11 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3687  outer membrane lipoprotein LolB  27.84 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0163127  normal  0.471305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  23.16 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  25 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0291  outer membrane lipoprotein LolB  19.9 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  24.03 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  22.22 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  20.48 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  23.97 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0174  hypothetical protein  27.03 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  27.03 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  23.66 
 
 		 494 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  25.56 
 
 		 211 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>