114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4272 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  97.35 
 
 
1508 aa  2951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  38.08 
 
 
1489 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
1508 aa  3019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  41.09 
 
 
1651 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  86.34 
 
 
1508 aa  2593    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.37 
 
 
1508 aa  2192    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.43 
 
 
1615 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  28.55 
 
 
1635 aa  473  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  28.02 
 
 
1618 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  24.56 
 
 
1615 aa  277  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  24.07 
 
 
1631 aa  265  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  35.6 
 
 
3443 aa  158  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.98 
 
 
1723 aa  158  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  35.6 
 
 
5212 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.23 
 
 
1730 aa  157  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  34.56 
 
 
2758 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.41 
 
 
2670 aa  154  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  41.04 
 
 
2827 aa  152  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  36.88 
 
 
3563 aa  151  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  36.52 
 
 
594 aa  148  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.77 
 
 
3040 aa  147  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.23 
 
 
3967 aa  147  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.02 
 
 
5981 aa  146  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  37.55 
 
 
6274 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.5 
 
 
3790 aa  143  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.06 
 
 
3796 aa  143  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  34.48 
 
 
3929 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2437  hypothetical protein  23.4 
 
 
889 aa  136  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16487  hitchhiker  0.0003202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.21 
 
 
3862 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  33.93 
 
 
1841 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  35.4 
 
 
1270 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.23 
 
 
2536 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  33.33 
 
 
3350 aa  132  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.56 
 
 
2600 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  35.25 
 
 
3165 aa  132  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  33.22 
 
 
3004 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.75 
 
 
658 aa  129  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  34.87 
 
 
3322 aa  128  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  32.28 
 
 
1998 aa  127  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.73 
 
 
3501 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  34.46 
 
 
3552 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.25 
 
 
2345 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.33 
 
 
923 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.85 
 
 
3079 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.05 
 
 
812 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.61 
 
 
2421 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 
3602 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.33 
 
 
428 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.76 
 
 
2588 aa  122  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.59 
 
 
3884 aa  122  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.47 
 
 
3128 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  34.93 
 
 
3141 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  34.93 
 
 
3141 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.33 
 
 
2847 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.2 
 
 
3785 aa  116  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35 
 
 
3020 aa  115  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.47 
 
 
721 aa  115  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  32.61 
 
 
2737 aa  115  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  34.44 
 
 
3147 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  35 
 
 
3159 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.29 
 
 
2666 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  35.44 
 
 
2984 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.15 
 
 
2786 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  35.56 
 
 
3301 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.05 
 
 
2818 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.71 
 
 
3028 aa  108  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  33.62 
 
 
3081 aa  107  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.52 
 
 
3141 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  29.52 
 
 
3144 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  29.52 
 
 
3131 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  30.25 
 
 
1745 aa  103  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  26.64 
 
 
2449 aa  103  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.36 
 
 
3480 aa  104  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.36 
 
 
3378 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  31.75 
 
 
2691 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.8 
 
 
3475 aa  103  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  32.61 
 
 
2751 aa  102  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.07 
 
 
4966 aa  102  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.94 
 
 
730 aa  95.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  30.04 
 
 
3526 aa  94.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  29.81 
 
 
893 aa  94.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  29.7 
 
 
914 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  30.22 
 
 
911 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  30.22 
 
 
905 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  30.22 
 
 
905 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  30.22 
 
 
898 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  29.7 
 
 
901 aa  93.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.14 
 
 
2545 aa  91.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.45 
 
 
846 aa  90.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  26.09 
 
 
2350 aa  90.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.82 
 
 
846 aa  89.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.68 
 
 
847 aa  89.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  25.85 
 
 
1719 aa  88.6  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  29.18 
 
 
716 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  31.17 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2933  filamentous haemagglutinin, N-terminal  27.97 
 
 
849 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.41 
 
 
262 aa  80.5  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  30.47 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.47 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.62 
 
 
678 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>