13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2437 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  72.44 
 
 		 1615 aa  1293    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2437  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1794    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16487  hitchhiker  0.0003202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  98.2 
 
 		 1631 aa  1758    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.07 
 
 		 1615 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  31.21 
 
 		 1635 aa  354  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  30.66 
 
 		 1618 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  27.03 
 
 		 1489 aa  207  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  25 
 
 		 1651 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.07 
 
 		 1508 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.4 
 
 		 1508 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.15 
 
 		 1508 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.55 
 
 		 1508 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0369  hemolysin  26.34 
 
 		 261 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.819842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>