108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2156 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  75.11 
 
 
1615 aa  2451    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.01 
 
 
1615 aa  727    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2437  hypothetical protein  98.2 
 
 
889 aa  1758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16487  hitchhiker  0.0003202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  100 
 
 
1631 aa  3304    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  30.85 
 
 
1635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  30.39 
 
 
1618 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  26.4 
 
 
1651 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  26.82 
 
 
1489 aa  373  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.07 
 
 
1508 aa  258  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.7 
 
 
1508 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.77 
 
 
1508 aa  249  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.09 
 
 
1508 aa  169  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2435  putative hemolysin  100 
 
 
64 aa  127  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760178  normal  0.0256714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.75 
 
 
3796 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.22 
 
 
5981 aa  119  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.37 
 
 
3790 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.57 
 
 
1730 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.46 
 
 
3967 aa  115  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  35.77 
 
 
6274 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.74 
 
 
3040 aa  112  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.46 
 
 
3862 aa  111  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.83 
 
 
2670 aa  110  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  33.2 
 
 
3563 aa  105  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  32.08 
 
 
3443 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  32.08 
 
 
5212 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  33.2 
 
 
594 aa  102  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.83 
 
 
2827 aa  102  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  30.15 
 
 
2758 aa  99.8  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.77 
 
 
1723 aa  99  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  28.74 
 
 
1998 aa  97.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  31.13 
 
 
3322 aa  94  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.94 
 
 
2345 aa  94  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  30.11 
 
 
3004 aa  94  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.35 
 
 
3602 aa  93.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.24 
 
 
2600 aa  91.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.52 
 
 
3884 aa  90.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0369  hemolysin  27.86 
 
 
261 aa  88.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.819842  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  32.35 
 
 
1745 aa  87.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.2 
 
 
721 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.23 
 
 
923 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.94 
 
 
812 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  27.69 
 
 
2530 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  27.69 
 
 
2588 aa  80.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.69 
 
 
2545 aa  80.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.45 
 
 
3020 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  27.09 
 
 
3350 aa  79.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.16 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.07 
 
 
3475 aa  79.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.32 
 
 
4966 aa  79.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  27.57 
 
 
3141 aa  79  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  27.57 
 
 
3141 aa  79  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.12 
 
 
3480 aa  77.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.49 
 
 
2421 aa  77.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  40.17 
 
 
1841 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.09 
 
 
658 aa  77.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.12 
 
 
3378 aa  77.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.04 
 
 
3785 aa  77.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  29.54 
 
 
2984 aa  77  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  30.04 
 
 
1270 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  29.28 
 
 
3501 aa  76.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  29.66 
 
 
3552 aa  76.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  24.49 
 
 
3141 aa  76.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  27.78 
 
 
3526 aa  76.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  38.46 
 
 
3929 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.15 
 
 
3128 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  28.52 
 
 
3081 aa  73.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.4 
 
 
3159 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  32.14 
 
 
463 aa  73.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.68 
 
 
262 aa  72.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  27.95 
 
 
2449 aa  72  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.53 
 
 
2847 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.61 
 
 
2818 aa  70.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.34 
 
 
3079 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  24.81 
 
 
3131 aa  69.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  28.89 
 
 
1719 aa  68.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  27.83 
 
 
2350 aa  68.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  41.23 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.23 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  25.1 
 
 
3144 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.31 
 
 
3028 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.27 
 
 
2782 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2933  filamentous haemagglutinin, N-terminal  21.79 
 
 
849 aa  65.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.37 
 
 
3301 aa  65.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.84 
 
 
678 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 
2666 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  25.6 
 
 
2536 aa  64.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.16 
 
 
681 aa  63.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  22.1 
 
 
2737 aa  62.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.19 
 
 
847 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0287  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.57 
 
 
143 aa  60.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  35.65 
 
 
846 aa  60.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  35.14 
 
 
846 aa  58.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.88 
 
 
730 aa  58.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.47 
 
 
678 aa  57.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  36.52 
 
 
2691 aa  57  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  26.69 
 
 
905 aa  53.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  26.69 
 
 
905 aa  53.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  26.69 
 
 
898 aa  53.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  26.69 
 
 
911 aa  53.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  34.78 
 
 
2751 aa  53.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>