164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2126 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  98.99 
 
 		 496 aa  1029    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  63.29 
 
 		 491 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  64.11 
 
 		 492 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  68.11 
 
 		 493 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  64.98 
 
 		 491 aa  664    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  66.11 
 
 		 491 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  62.65 
 
 		 491 aa  684    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  93.15 
 
 		 496 aa  979    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  67.28 
 
 		 492 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  66.24 
 
 		 491 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  69.59 
 
 		 493 aa  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  68.08 
 
 		 490 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  68.11 
 
 		 493 aa  726    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  68.5 
 
 		 490 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  67.69 
 
 		 491 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  65.84 
 
 		 492 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  65.24 
 
 		 492 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  68.76 
 
 		 492 aa  734    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  67.86 
 
 		 491 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  66.11 
 
 		 492 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1035    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  68.37 
 
 		 493 aa  740    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  67.3 
 
 		 492 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  66.53 
 
 		 491 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  68.11 
 
 		 493 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  62.45 
 
 		 491 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  67.86 
 
 		 491 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  60.46 
 
 		 760 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  59.5 
 
 		 492 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  60.46 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  60.46 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  60.46 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  60.46 
 
 		 499 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  60.46 
 
 		 499 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  60.46 
 
 		 499 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  60.25 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  60.13 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  55.6 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  54.68 
 
 		 482 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  44.32 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  43.56 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  44.58 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  41.72 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  41.2 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  41.87 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  42.89 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  41.43 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  41.43 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  41.2 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  41.2 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  42.41 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  41.43 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  40.76 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  38.78 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.71 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.89 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  39.78 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  37.93 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  37.93 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  41.92 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  37.93 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  37.93 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  37.73 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  37.73 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  37.73 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  41.92 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  37.88 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  36.66 
 
 		 499 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  37.88 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  37.88 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  37.73 
 
 		 496 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  37.95 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  37.74 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  41.69 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  39.76 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  39.76 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  39.96 
 
 		 494 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  39.32 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  39.32 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  39.32 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.59 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  38.92 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  41.11 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  41.09 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.52 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  40.42 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  40.42 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  40.42 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5979  EvpB family type VI secretion protein  38.49 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  40.45 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.88 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  40.89 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  37.68 
 
 		 497 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  40.89 
 
 		 502 aa  346  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  40.65 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>