More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3748 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  94.08 
 
 		 293 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  92.68 
 
 		 287 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  90.24 
 
 		 287 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  72.73 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  67.6 
 
 		 286 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  48.75 
 
 		 289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  49.82 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  48.75 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  48.23 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  48.75 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  46.98 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  46.32 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  46.32 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  46.32 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  46.32 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  46.02 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  46.32 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  46.62 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  45.49 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  45.2 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  44.84 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  44.84 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  46.81 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  43.75 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  44.84 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  44.1 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  43.8 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  44.52 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.08 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  44.84 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  45.2 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  45.39 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  42.91 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  42.39 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  42.09 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  42.55 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  42.45 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  42.4 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  42.09 
 
 		 294 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  42.4 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  42.45 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  42.2 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  42.45 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  41.9 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  41.49 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  40.99 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  41.34 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  42.61 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  41.99 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  44.84 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  40.07 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  42.44 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  42.05 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  44.32 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  41.49 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  40.73 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  39.36 
 
 		 314 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  40.73 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  43.59 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  41.64 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  40.44 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  43.22 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  39.78 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  47.5 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  38.65 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  37.23 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  38.73 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  39.58 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  40.51 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  41.79 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  39.58 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  38.65 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  38.29 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  42.7 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  39.03 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  38.91 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  40.64 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  37.82 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  37.72 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  38.6 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  37.59 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  38.72 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  35.19 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  38.82 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  34.84 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  34.84 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  34.78 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  36.98 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  34.67 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>