More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1634 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  98.82 
 
 
254 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  69.87 
 
 
312 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  70 
 
 
311 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  67.31 
 
 
314 aa  427  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  64.84 
 
 
310 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  64.86 
 
 
313 aa  414  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  61.94 
 
 
311 aa  407  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  62.7 
 
 
311 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  56.37 
 
 
312 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  56.37 
 
 
312 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  57.51 
 
 
309 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  55.73 
 
 
312 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  54.17 
 
 
318 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  51.6 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  51.76 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  48.87 
 
 
306 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  49.52 
 
 
307 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  52.55 
 
 
306 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  51.75 
 
 
306 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  49.84 
 
 
307 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  50.96 
 
 
305 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  49.36 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  49.68 
 
 
305 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  48.72 
 
 
307 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  50.85 
 
 
290 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  48.4 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  48.73 
 
 
305 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  49.49 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  49.15 
 
 
289 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  50.34 
 
 
307 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  48.64 
 
 
289 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  50 
 
 
307 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  51.7 
 
 
307 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.64 
 
 
291 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  47.4 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  45.25 
 
 
306 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  46.44 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  50.37 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  45.92 
 
 
293 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  48.3 
 
 
296 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  47.42 
 
 
291 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  50 
 
 
293 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  47.28 
 
 
294 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  45.42 
 
 
291 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  50 
 
 
293 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  50 
 
 
293 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  46.1 
 
 
293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  46.1 
 
 
293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  48.89 
 
 
294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  46.76 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  48.51 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  45.76 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  45.67 
 
 
296 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  46.9 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  45.21 
 
 
287 aa  242  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  48.16 
 
 
340 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  47.47 
 
 
298 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  47.1 
 
 
304 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  47.78 
 
 
293 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  45.61 
 
 
293 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  45.92 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  45.39 
 
 
293 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  44.56 
 
 
291 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  49.28 
 
 
274 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  47.28 
 
 
296 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  46.18 
 
 
296 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  45.58 
 
 
306 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  43.24 
 
 
294 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  45.42 
 
 
293 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  45.08 
 
 
307 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  45.42 
 
 
293 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  41.64 
 
 
294 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  45.08 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  45.08 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  45.08 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  45.08 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  45.61 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  42.81 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  43.01 
 
 
301 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  44.4 
 
 
304 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  39.64 
 
 
296 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  38.51 
 
 
290 aa  205  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  41.13 
 
 
293 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  40.78 
 
 
287 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  40.52 
 
 
287 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  36.58 
 
 
293 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  43.52 
 
 
299 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  36.58 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  45.35 
 
 
298 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  38.06 
 
 
343 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  38.69 
 
 
332 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  38.69 
 
 
315 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  38.43 
 
 
301 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  34.63 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  37.05 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  34.77 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>