More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2016 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  100 
 
 		 343 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  50.98 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  52.48 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  50.58 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  51.91 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  47.26 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  50.58 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  51.61 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  50.15 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  46.74 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  47.56 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  49.38 
 
 		 351 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  47.48 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  46.8 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  45.59 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  47.9 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  48.09 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  48.09 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  48.09 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  46.88 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  43.58 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  47.32 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  42.67 
 
 		 363 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  43.58 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  44.82 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  43.71 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  44.21 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  41.4 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  41.05 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  41.98 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  38.46 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  36.25 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  36.66 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  39.44 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  39.08 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  40.07 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  39.29 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  36.97 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  40.52 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.29 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  37.92 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  39.61 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  41.13 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  41.13 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  34.41 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  38.71 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  35.42 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  36.21 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  38.13 
 
 		 306 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  40.44 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  39.16 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  40.26 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  40.45 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  34.85 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  33.86 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  37.27 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  34.29 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  37.91 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  37.18 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  40.21 
 
 		 307 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  35.14 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  36.51 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  35.52 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  37.88 
 
 		 294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  37.18 
 
 		 290 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  40.61 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  37.96 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  38.55 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  39.77 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  35.84 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  36.9 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  42.18 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  39.85 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  37.59 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  40.44 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  40.38 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  36.33 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  36.56 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  35.71 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  38.82 
 
 		 287 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  39.61 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  37.03 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.83 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  37.46 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  40.29 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  39.27 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  40.29 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  39.1 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  35.02 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  40.36 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  40.36 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  35.77 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  37.74 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>