More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0493 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  75.41 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  74.75 
 
 		 307 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  67.21 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  67.87 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  67.82 
 
 		 290 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  55.08 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  57.38 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  56.17 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  56.49 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  51.77 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  55.88 
 
 		 305 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  51.61 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  54.25 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  54.43 
 
 		 312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  54.1 
 
 		 312 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  54.25 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  54.1 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  53.92 
 
 		 305 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  52.94 
 
 		 305 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  50 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  52.29 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  51.94 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  52.04 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  47.42 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  53 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  50.87 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  51.57 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  51.01 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  53.17 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  51.22 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  50 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.93 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  48.72 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  51.21 
 
 		 291 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  50.52 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  51.39 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  50.52 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  50.52 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  50.52 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  49.48 
 
 		 291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  50.69 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  50 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  50.17 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  49.31 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  49.13 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  48.96 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  49.13 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 297 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  48.79 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  48.78 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  48.61 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  48.44 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  48.61 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  48.1 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  45.99 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  45.17 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  44.25 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  48.54 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  47.75 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  47.75 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  47.75 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  47.75 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  47.45 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  47.81 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  46.83 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  46.55 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  48.18 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  45.14 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  49.66 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  43.94 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  46.83 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  43.21 
 
 		 300 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  43.73 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  44.89 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  45.09 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  46.09 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  41.4 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  46.88 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  39.93 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  38.52 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  38.91 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  40.94 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  39.16 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  39.16 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  37.93 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  38.81 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  36.77 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>