More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4923 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  100 
 
 
310 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  84.52 
 
 
311 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  74.52 
 
 
311 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  71.61 
 
 
314 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  70.1 
 
 
313 aa  457  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  69.35 
 
 
312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  65.48 
 
 
311 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  64.84 
 
 
310 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  56.91 
 
 
305 aa  345  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  56.77 
 
 
312 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  53.55 
 
 
307 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  57.42 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  55.81 
 
 
312 aa  341  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  55.81 
 
 
312 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  53.23 
 
 
307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  56.41 
 
 
305 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  52.9 
 
 
306 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  54.84 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  55.31 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  54.02 
 
 
305 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  55.13 
 
 
306 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  51.61 
 
 
307 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  62.06 
 
 
254 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  52.73 
 
 
306 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  54.02 
 
 
305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  52.56 
 
 
305 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  52.26 
 
 
318 aa  321  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  52.72 
 
 
290 aa  321  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  53.08 
 
 
307 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  52.74 
 
 
307 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  51.2 
 
 
306 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  53.42 
 
 
296 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  51.54 
 
 
293 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  51.54 
 
 
293 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  51.19 
 
 
293 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  52.58 
 
 
293 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  52.74 
 
 
307 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  51.36 
 
 
289 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  51.03 
 
 
293 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  51.2 
 
 
293 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  51.2 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  50.68 
 
 
291 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  50.34 
 
 
291 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  50.51 
 
 
291 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  50.87 
 
 
296 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  49.65 
 
 
294 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  52.79 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  51.2 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  48.98 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  52 
 
 
297 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  48.45 
 
 
287 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  50 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  49.66 
 
 
293 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  51.64 
 
 
294 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  48.98 
 
 
289 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  50 
 
 
298 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  47.85 
 
 
304 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  50.91 
 
 
294 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  49.32 
 
 
291 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  49.66 
 
 
293 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  49.66 
 
 
293 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  48.81 
 
 
291 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 
293 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  50 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 
293 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  50.17 
 
 
293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  50.17 
 
 
293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  50.17 
 
 
293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  50.17 
 
 
293 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  48.63 
 
 
294 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  47.78 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  52 
 
 
274 aa  261  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  48.64 
 
 
306 aa  261  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  49.66 
 
 
296 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  48.64 
 
 
296 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  45.88 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  47.06 
 
 
307 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  46.24 
 
 
301 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  45.88 
 
 
301 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  46.95 
 
 
304 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  49.1 
 
 
304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  45.3 
 
 
299 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  46.58 
 
 
316 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  37.63 
 
 
290 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 
287 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  38.26 
 
 
296 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  38.65 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  39.72 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  40.07 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
293 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  45.21 
 
 
298 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  36.27 
 
 
300 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  38.28 
 
 
332 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  38.28 
 
 
315 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  40.61 
 
 
301 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  38.89 
 
 
335 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  37.15 
 
 
301 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  38.57 
 
 
313 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  37.32 
 
 
329 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>