44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1347 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  78.74 
 
 		 172 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  93.9 
 
 		 174 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  76.54 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  76.54 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  65.22 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  59.77 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  65.84 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  60.34 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  34.73 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  27.86 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  37.96 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  37.96 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  24.82 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  34.26 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  26.22 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  26.22 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  52.54 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  50.98 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  44 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  48.21 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  41.33 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  48.21 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  47.5 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  35.14 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  31.75 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  54.29 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  54.29 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  39.62 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  36 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  23.02 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  39.62 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  51.43 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  31.33 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  31.34 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  35.85 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>