45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0710 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  97.89 
 
 		 620 aa  1220    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  97.89 
 
 		 617 aa  1219    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  70.66 
 
 		 617 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  71.84 
 
 		 618 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  72.01 
 
 		 618 aa  933    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1269    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  95.46 
 
 		 617 aa  1220    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  79.25 
 
 		 617 aa  1021    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  67.26 
 
 		 620 aa  850    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  77.15 
 
 		 617 aa  1000    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  76.82 
 
 		 617 aa  983    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  40.6 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  36.85 
 
 		 622 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  35.66 
 
 		 648 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  37.74 
 
 		 629 aa  330  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  35.25 
 
 		 625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  33.51 
 
 		 631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  33.16 
 
 		 600 aa  306  6e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  33.39 
 
 		 630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  36.07 
 
 		 668 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  36.07 
 
 		 665 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  35.71 
 
 		 664 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  34.71 
 
 		 678 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  31.54 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  35.16 
 
 		 645 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  26.6 
 
 		 670 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  28.2 
 
 		 718 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  28.02 
 
 		 720 aa  207  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  27.13 
 
 		 636 aa  193  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  23.53 
 
 		 618 aa  148  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  24.21 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  27.39 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  25.95 
 
 		 651 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  27.49 
 
 		 648 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  25.95 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  23.79 
 
 		 651 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  28.67 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  24.59 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  24.59 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  26.9 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  28.67 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  27.13 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  24.26 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  28.17 
 
 		 664 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>