45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4587 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  77.15 
 
 		 620 aa  982    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1274    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  77.15 
 
 		 617 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  97.24 
 
 		 617 aa  1244    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  65.65 
 
 		 620 aa  847    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  69.9 
 
 		 618 aa  908    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  71.2 
 
 		 617 aa  912    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  80.71 
 
 		 617 aa  1037    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  69.58 
 
 		 618 aa  903    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  76.82 
 
 		 617 aa  978    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  77.47 
 
 		 617 aa  998    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  39 
 
 		 619 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  36.4 
 
 		 622 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  37.59 
 
 		 629 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  37.42 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  37.43 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  35.03 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  34.53 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  31.14 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  35.38 
 
 		 668 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  35.02 
 
 		 664 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  35.02 
 
 		 665 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  32.39 
 
 		 642 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  35.58 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  32.5 
 
 		 678 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  26.92 
 
 		 670 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  27.29 
 
 		 718 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  26.57 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  25.7 
 
 		 636 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  26.38 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  24.32 
 
 		 618 aa  157  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  28.75 
 
 		 653 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  26.71 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  26.09 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  25 
 
 		 652 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  25 
 
 		 652 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  25.47 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  25.61 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  25.61 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  25.47 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  25.47 
 
 		 648 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  27.71 
 
 		 664 aa  52  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  25 
 
 		 651 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  24.84 
 
 		 652 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>