36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5469 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  68.87 
 
 		 652 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  73.97 
 
 		 652 aa  968    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  75.35 
 
 		 648 aa  989    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  68.87 
 
 		 652 aa  848    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  74.85 
 
 		 651 aa  991    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  74.88 
 
 		 648 aa  990    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  69.63 
 
 		 651 aa  851    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  79.5 
 
 		 653 aa  1048    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  92.96 
 
 		 653 aa  1251    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  67.43 
 
 		 664 aa  864    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  45.05 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  45.05 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  42.99 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  26.63 
 
 		 625 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  25.47 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  24.79 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  26.71 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  28.74 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  26.32 
 
 		 630 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  26.32 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  25.93 
 
 		 668 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  26.09 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  25 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  25.86 
 
 		 670 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  29.82 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  27.34 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  25.16 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  28.68 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  25.16 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  27.34 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  32.5 
 
 		 618 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  23.61 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  25 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  28.68 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>