45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0678 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1276    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  98.87 
 
 		 617 aa  1253    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  71.15 
 
 		 617 aa  903    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  72.17 
 
 		 618 aa  935    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  72.33 
 
 		 618 aa  937    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  97.89 
 
 		 617 aa  1220    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  96.11 
 
 		 617 aa  1227    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  79.9 
 
 		 617 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  67.42 
 
 		 620 aa  855    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  77.47 
 
 		 617 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  77.15 
 
 		 617 aa  987    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  40.64 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  37.19 
 
 		 622 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  35.5 
 
 		 648 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  37.91 
 
 		 629 aa  333  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  35.81 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  34.14 
 
 		 631 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  34.22 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  32.99 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  36.3 
 
 		 668 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  36.3 
 
 		 665 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  35.77 
 
 		 664 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  34.45 
 
 		 678 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  31.97 
 
 		 642 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  34.95 
 
 		 645 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  26.92 
 
 		 670 aa  220  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  28.78 
 
 		 718 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  28.48 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  27.51 
 
 		 636 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  23.86 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  24.02 
 
 		 615 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  26.92 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  26.19 
 
 		 653 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  27.49 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  25.77 
 
 		 651 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  23.65 
 
 		 651 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  25.77 
 
 		 648 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  28.67 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  24.59 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  24.59 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  28.67 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  26.9 
 
 		 652 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  27.13 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  25.16 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  28.17 
 
 		 664 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>