39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06072 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1244    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1244    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  53.06 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  45.05 
 
 		 653 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  44.29 
 
 		 653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  46.66 
 
 		 652 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  46.89 
 
 		 652 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  43.35 
 
 		 653 aa  458  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  44.22 
 
 		 648 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  43.76 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  41.83 
 
 		 652 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  43.93 
 
 		 651 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  45.45 
 
 		 651 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  44.24 
 
 		 664 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  29.56 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  26.29 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  28.3 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  25.46 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  29.9 
 
 		 629 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  25 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  24.88 
 
 		 622 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  24.44 
 
 		 617 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  24.59 
 
 		 617 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  27.21 
 
 		 618 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  24.59 
 
 		 620 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  27.21 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  25.61 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  25.61 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  21.97 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  22.98 
 
 		 630 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  25.94 
 
 		 665 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  22.98 
 
 		 631 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  25.66 
 
 		 668 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  24.77 
 
 		 670 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  23.66 
 
 		 718 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  25.9 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  25.33 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  22.87 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>