45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0513 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1389    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  47.74 
 
 		 718 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  46.57 
 
 		 720 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  26.92 
 
 		 617 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  26.92 
 
 		 620 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  27.75 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  27.54 
 
 		 618 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  26.46 
 
 		 617 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  26.6 
 
 		 617 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  27.04 
 
 		 617 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  26.8 
 
 		 617 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  26.13 
 
 		 617 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  27.04 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  26.49 
 
 		 617 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  37.23 
 
 		 625 aa  195  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  34.45 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  26.81 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  32.89 
 
 		 648 aa  176  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  27.27 
 
 		 631 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  35.69 
 
 		 629 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  32.05 
 
 		 600 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  27.33 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  30.1 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  33.01 
 
 		 665 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  32.68 
 
 		 668 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  30.88 
 
 		 642 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  29.36 
 
 		 619 aa  148  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  32.32 
 
 		 645 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  30.77 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  29.33 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  30.56 
 
 		 615 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  25.75 
 
 		 648 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  25.75 
 
 		 648 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  25.86 
 
 		 653 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  24.89 
 
 		 652 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  24.51 
 
 		 598 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  25.75 
 
 		 651 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  25.86 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  25.89 
 
 		 664 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  24.77 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  24.77 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 653 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  24.68 
 
 		 652 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  24.68 
 
 		 652 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  21.68 
 
 		 651 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>