36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2382 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1325    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  42.16 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  40.79 
 
 
631 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  40.41 
 
 
630 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  36.19 
 
 
600 aa  334  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  35.69 
 
 
629 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  35.7 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  36.07 
 
 
618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  34.9 
 
 
617 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  34.65 
 
 
622 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  32.39 
 
 
617 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  32.46 
 
 
617 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  35.29 
 
 
620 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  31.07 
 
 
625 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  32.73 
 
 
620 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  31.69 
 
 
617 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  32.36 
 
 
617 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  35.86 
 
 
645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  32.22 
 
 
617 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  32.39 
 
 
617 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  36.13 
 
 
665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  30.25 
 
 
619 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  35.77 
 
 
668 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  35.22 
 
 
664 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  32.61 
 
 
678 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  24.74 
 
 
718 aa  163  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  30.88 
 
 
670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  24.37 
 
 
615 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  25.96 
 
 
636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  28.7 
 
 
720 aa  143  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  23.08 
 
 
618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  25.78 
 
 
653 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  24.81 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  26.57 
 
 
664 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  25 
 
 
653 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  25.95 
 
 
648 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>