41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0046 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  96.26 
 
 
668 aa  1134    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  96.1 
 
 
665 aa  1135    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  66.5 
 
 
645 aa  735    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  100 
 
 
664 aa  1288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  45.45 
 
 
678 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  35.69 
 
 
631 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  37.15 
 
 
630 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  35.82 
 
 
620 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  34.83 
 
 
618 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  35.82 
 
 
617 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  35.46 
 
 
617 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  36.25 
 
 
648 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  35.64 
 
 
617 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  36.45 
 
 
620 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  34.46 
 
 
618 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  35.25 
 
 
622 aa  266  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  35.07 
 
 
617 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  34.48 
 
 
617 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  34.12 
 
 
625 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  33.79 
 
 
617 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  35.62 
 
 
629 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  35.2 
 
 
617 aa  257  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  34.85 
 
 
642 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  32.16 
 
 
600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  29.74 
 
 
619 aa  220  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  27 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  28.1 
 
 
670 aa  164  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  27.03 
 
 
636 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  26.94 
 
 
720 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  27.25 
 
 
615 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  22.26 
 
 
618 aa  104  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  26.06 
 
 
651 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  26.06 
 
 
648 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  26.81 
 
 
664 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  24.65 
 
 
652 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  25.15 
 
 
652 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  25.15 
 
 
652 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  24.83 
 
 
648 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  25.9 
 
 
623 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  29.41 
 
 
598 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  25.9 
 
 
623 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>