36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0106 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  76.82 
 
 		 648 aa  1024    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  67.23 
 
 		 664 aa  863    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  76.26 
 
 		 652 aa  999    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  77.59 
 
 		 648 aa  1026    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  69.64 
 
 		 652 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  69.16 
 
 		 651 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  69.23 
 
 		 652 aa  856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1330    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  77.79 
 
 		 653 aa  1052    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  76.23 
 
 		 651 aa  1021    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  79.02 
 
 		 653 aa  1068    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  43.2 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  43.39 
 
 		 623 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  43.39 
 
 		 623 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  28.22 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  27.83 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  24.73 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  28.75 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  28.75 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  30.88 
 
 		 620 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  26.19 
 
 		 620 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  26.19 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  26.19 
 
 		 617 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  25.98 
 
 		 622 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  25.6 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 630 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 631 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  29.2 
 
 		 618 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  32.22 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  25.79 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  25.09 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  26.12 
 
 		 678 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  24.81 
 
 		 642 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  24 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  24.92 
 
 		 668 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>