32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4438 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  68.36 
 
 		 651 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  69.29 
 
 		 652 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  68.06 
 
 		 648 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  68.06 
 
 		 648 aa  883    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1289    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  69.45 
 
 		 652 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  66.56 
 
 		 652 aa  862    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  69.26 
 
 		 653 aa  882    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  67.69 
 
 		 653 aa  882    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  71.34 
 
 		 664 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  68.61 
 
 		 653 aa  895    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  45.19 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  45.19 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  43.15 
 
 		 598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  27.59 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  25.26 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  23.79 
 
 		 617 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  23.79 
 
 		 620 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  24.07 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  29.69 
 
 		 625 aa  54.3  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  26.56 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  25.61 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  30.43 
 
 		 648 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  25 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  29.9 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  24.86 
 
 		 617 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  25.37 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  25.6 
 
 		 617 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  27.61 
 
 		 631 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  25.49 
 
 		 629 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  26.99 
 
 		 630 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  21.68 
 
 		 670 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>