37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1790 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1182    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  52.98 
 
 
623 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  52.98 
 
 
623 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  42.97 
 
 
653 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  42.95 
 
 
648 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  45.44 
 
 
652 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  42.32 
 
 
651 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  42.16 
 
 
648 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  45.53 
 
 
652 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  42.68 
 
 
653 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  42.48 
 
 
652 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  42.99 
 
 
653 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  44.03 
 
 
664 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  43.27 
 
 
651 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  27.5 
 
 
620 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  27.72 
 
 
622 aa  67  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  27.78 
 
 
625 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  27.05 
 
 
617 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  27.39 
 
 
617 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  26.57 
 
 
620 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  26.92 
 
 
617 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  27.36 
 
 
617 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  25.63 
 
 
617 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  26.01 
 
 
631 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  25.85 
 
 
618 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  30.43 
 
 
617 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  30.43 
 
 
617 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  25.98 
 
 
630 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  25.37 
 
 
618 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  24.51 
 
 
670 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  29.27 
 
 
629 aa  54.3  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  29.71 
 
 
648 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  29.71 
 
 
619 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  25.76 
 
 
678 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  25.12 
 
 
600 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  29.41 
 
 
664 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 
668 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>