45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  67.72 
 
 
620 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  67.88 
 
 
617 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  70.97 
 
 
617 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  70.97 
 
 
618 aa  891    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  71.13 
 
 
618 aa  898    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  67.55 
 
 
617 aa  840    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  66.77 
 
 
617 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  65.32 
 
 
617 aa  843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1240    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  66.45 
 
 
617 aa  854    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  65.65 
 
 
617 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  38.79 
 
 
619 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  37.95 
 
 
622 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  37.72 
 
 
629 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  38.94 
 
 
648 aa  337  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  38.46 
 
 
625 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  35.02 
 
 
631 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  35.84 
 
 
630 aa  309  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  32.78 
 
 
600 aa  301  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  36.53 
 
 
668 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  36.73 
 
 
664 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  35.58 
 
 
665 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  36.55 
 
 
678 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  35.29 
 
 
642 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  39.54 
 
 
645 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  30.13 
 
 
718 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  29.34 
 
 
720 aa  213  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  28.12 
 
 
636 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  34.45 
 
 
670 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  27.71 
 
 
615 aa  177  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  22.99 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  27.5 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  24.56 
 
 
653 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  27.59 
 
 
651 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  24.79 
 
 
653 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  30.88 
 
 
653 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  28.02 
 
 
664 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  26.22 
 
 
651 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  26.22 
 
 
648 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  29.61 
 
 
652 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  29.61 
 
 
652 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  27.65 
 
 
648 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  25.46 
 
 
623 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  25.46 
 
 
623 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  27.06 
 
 
652 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>