31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3805 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1280    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  32.14 
 
 		 636 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  28.04 
 
 		 625 aa  187  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  26 
 
 		 619 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  27.71 
 
 		 620 aa  177  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  26.77 
 
 		 622 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  26.54 
 
 		 618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  26.36 
 
 		 618 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  23.19 
 
 		 629 aa  171  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  25.56 
 
 		 617 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  26.03 
 
 		 617 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  25.87 
 
 		 617 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  26.34 
 
 		 648 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  26.38 
 
 		 617 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  26.36 
 
 		 600 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  35.5 
 
 		 665 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  35.88 
 
 		 664 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  35.5 
 
 		 668 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  24.02 
 
 		 620 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  24.21 
 
 		 617 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  25.33 
 
 		 617 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  23.65 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  26 
 
 		 645 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  24.37 
 
 		 642 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  25.55 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  26.06 
 
 		 630 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  24.2 
 
 		 631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  30.25 
 
 		 718 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  28.47 
 
 		 720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  30.56 
 
 		 670 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  25.75 
 
 		 618 aa  91.3  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>